組織機構是促進計劃生產、實施、評估的機構，是用來分配企業(yè)人力資源，以實現(xiàn)企業(yè)經(jīng)營目標的正式或非正式的體制。物流組織職能就是設計各部門的職能和職權，確定組織中職能職權、參謀職權、直線職權的活動范圍，并隨著組織內外環(huán)境不斷的變化而不斷修正的過程。物流組織職能其目的就是通過職能、職權的設置和不不斷修正，使得企業(yè)里負責物流活動人員，能夠更好地相互協(xié)調和相互協(xié)作。

任何類型的企業(yè)或組織都會進行物流活動，傳統(tǒng)的物流職能是圍繞財務、動作和營銷這三個部門職能來組織物流活動。物流活動在實際運作過程中，出現(xiàn)不連續(xù)的現(xiàn)象，導致效率下降。原因是這個部門與物流職能的目標存在差異，營銷部門的首要職責是使利潤最大化，財務部門首要職責是投資收益最大化，運作部門則是單位成本最小化。作業(yè)績效考核以及與利潤的關聯(lián)，促使部門的決策產生沖突，甚至影響企業(yè)是非常休業(yè)績。比如營銷部門會希望快速送貨，而不考慮成本，生產部門負責運輸則期望批量送貨。因此，設置一個組織機構來協(xié)調不同的物流活動的決策是非常必要的。正如管理大師彼得.德魯克所說，“一個好的組織機構本身并不創(chuàng)造好的業(yè)績，就好比一步完善的憲法并不能保證產生偉大的總統(tǒng)、嚴謹?shù)姆桑蛘呤且粋€道德的社會。但無論個別的管理者多么優(yōu)秀，沒有好的組織結構也不可能創(chuàng)造出好的業(yè)績。因此，改善組織結構。。。。。。通常能夠提高效率”。物流組織職能的作用可見一斑。

從一般的角度看，物流活動的組織結構也不會不斷地演變進展。企業(yè)具體物流組織職能的發(fā)揮取決于其內部物流活動的特點，根據(jù)物流活動特點對物流組織職能定位是一個前提條件。所謂的定位是關系到將這些經(jīng)營活動放在企業(yè)組織結構中的什么位置，通常它由下列問題決定，即物流活動是分散式管理還是集中式管理，是幕僚管理還是直線管理。